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#bioimaging

3 Beiträge2 Beteiligte2 Beiträge heute
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NFDI4BIOIMAGE

The first poster session of #ELMI2025 which took place on Helix A last night, provided an ideal setting to exchange ideas with friends and colleagues about #bioimaging and #rdm.

Exciting projects were presented by @nfdi4bioimage including OMERO-vitessce and the IO-FAST initiative. Our data stewards were also on site, ready to offer advice on bioimaging #datamanagement.

Today, we will continue with talks, workshops, and the second poster session. We look forward to more inspiring talks! 🔬

preLights

In Ep 12 of #spotLights, Jonathan Townson talks to Daniel Booth about his lab's recent #preprints (cell division mechanisms & new bioimaging tools), presented at #biologists100. One was recently published @J_Cell_Sci !

They also explore the value of preprinting for early-career PIs and their teams.

Listen below ⬇️ 🎧
youtu.be/Uk5EBqmfFhY

YouTubespotLights Ep 12: preLights in conversation with Daniel BoothVon The Company of Biologists
#podcast#CellBiology#Bioimaging
NFDI4BIOIMAGE

#MeetOurDataStewards: The NFDI4BIOIMAGE Community Support Taskorce 👨‍💻

No matter your research field, @nfdi4bioimage supports you in managing imaging #data. This process requires not only time and expertise, but also specialists who understand #bioimaging data.

Over the next few months, we will introduce one expert from our Data Steward team each month. We look forward to sharing their exciting projects, publications, and helpful tips with you.

Data Stewards overview: nfdi4bioimage.de/about-us/data

NFDI4BIOIMAGE

Efficient, standards-based #bioimaging data management is essential for research and data reuse. Join @nfdi4bioimage's presentation about “A Journey to #FAIR Bioimage Data,” a contribution to @ells_heidelberg's STANDFLOW project webinar series:

🗓️July 2, 2025 | 02:30–03:30 pm | Online & Free

✅ Local data management: #OMERO & beyond
✅ Annotation: metadata, ontologies, REMBI
✅ Linking images with protocols & results
✅ Cloud storage: ome.zarr
✅ Data publication

👉 Register: ebi.ac.uk/training/events/jour

NFDI4BIOIMAGE

The high degree of heterogeneity in #bioimaging #metadata makes collaboration difficult and often leads to the loss of relevant metadata. In the presentation “Bioimaging Metadata”, which our @nfdi4bioimage colleagues Susanne Kunis and @joshmoore gave a few weeks ago, they discuss the reasons for this heterogeneity and which standards can be used to work towards loss-free and reusable metadata.

They have posted their slides on Zenodo:
👉 lnkd.in/ej7yDWQz

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NFDI4BIOIMAGE

@nfdi4bioimage experts will share best practices for #FAIR #bioimaging data in the webinar series "How to organise and share my imaging data?" from May 14 to July 2, 2025, organised by the STANDFLOW project and supported by @emblebi. 🌊

➡️ May 28: Towards Open and Standardized Imaging Data: An Introduction to Bio-Formats, OME-TIFF, and OME-Zarr | @joshmoore

➡️ July 2: A journey to FAIR bioimage data | Christian Schmidt, Tom Boissonnet, Stefanie Weidtkamp-Peters

👉 ebi.ac.uk/training/events/how-

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Oliver Brendel

The Silva unit of INRAE recruits an engineer in biological #imaging using SEM and optical #Microscopes, submissions open until 20 March 2025. More information at jobs.inrae.fr/concours/concour

more about the Silva unit at : eng-silva.nancy.hub.inrae.fr/

Please #Share widely in your #AcademicNetworks
#Microscopy #ElectronMicroscopy #BioImaging #Forests #PlantScience #SciJobs #Vacancy #JobVacancy #JobOpening #JobOpportunity #ResearchJobs #Academia @academicchatter 1/3

INRAE JobsIngénieur-e biologiste en imagerieIR25-ECODIV-2 - Vous intégrerez l'Unité mixte de recherche (UMR) SILVA (INRAE, AgroParisTech, Université de Lorraine). L'unité a pour objectif de développer des travaux pluridisciplinaires sur l'adaptation des écosystèmes forestiers aux changements globaux. Intégrée à SILVA, la plateforme technologique SILVATECH labellisée par INRAE propose des services d'analyses, de développement et de formation à partir d'une gamme d'équipements de haute technologie regroupés dans deux pôles : Isotopie-Chimie (IC) et Imagerie et Mesures Multi-Modales (I3M) que vous intégrerez pour y assurer les missions suivantes :- En collaboration avec les communautés de recherches locales, nationales et européennes, vous mettrez à profit vos connaissances et vos compétences initiales fortes en biologie et physiologie végétale aux échelles fines, pour mieux appréhender et caractériser par imagerie, les réponses physiologiques et anatomiques de l'arbre aux contraintes de son environnement. Dans le cadre du projet de recherche de l'unité SILVA, vous conduirez des travaux permettant d'identifier des marqueurs anatomiques et physiologiques de la tolérance ou de la vulnérabilité de l'arbre aux stress multiples (ex : sécheresse, ennoyage, vent, attaque biotique). Pour ce faire, vous serez chargé-e de développer des méthodologies de microscopie corrélative permettant de combiner les informations biologiques acquises, à partir de différents équipements, sur les mêmes échantillons par des approches multi-échelles et multi-techniques. Ces approches corrélatives permettront de créer des passerelles entre les échelles micro à nanométriques mais aussi de combiner des informations structurales et fonctionnelles voire dynamiques à partir des échantillons observés. Pour ce faire, vous développerez des itinéraires méthodologiques complets et intégrés à partir du large éventail d'équipements récents présents sur le pôle I3M (2 Cryo-MEB équipés en micro-analyse EDS, WDS et RX, un microscope confocal à balayage laser, un microscope à microdissection laser, une station d'imagerie photonique numérique, un multiscanner RX, un système d'imagerie hyperspectrale, divers équipements reposant sur l'utilisation des rayons X ainsi que des équipements de préparations en microscopie, un plateau de préparation en histologie) et dynamiserez les liens entre les approches présentes sur le pôle (densité stomatique, densité des vaisseaux du bois, anatomie quantitative à grande échelle, dendrométrie/chronologie/chimie). - Vous coanimerez le pôle I3M constitué de neuf agents, en assurant des activités telles que la gestion des plannings et activités des agents, le développement et la validation de méthodes, le contrôle et gestion de la maintenance, l'investissement significatif dans la prévision, l'élaboration et la conduite des dossiers stratégiques (achat d'équipement, expertise), l'apport d'expertise au montage de projets et l'application des démarches qualités. Pour mener à bien cette mission, vous travaillerez en relation étroite avec les autres animateurs de pôle et le responsable de la plateforme Silvatech.- Vous coordonnerez une partie du parc d'équipements associé au pôle I3M en collaboration avec leurs responsables techniques.- Vous assurez et/ou coordonnerez la formation de stagiaires/doctorants/post-doc aux techniques et équipements de microscopie dans un cadre local ou national.- Vous vous impliquerez fortement dans les réseaux technologiques (ex : RCCM-RIME, COST COMULIS) afin d'assurer la veille technologique et la valorisation de vos travaux de développement dans ces communautés. Cette valorisation passera également par la rédaction et la participation active à des publications scientifiques aussi bien en biologie qu'en techniques instrumentales.
QuenchedChemist

On behalf of the Organizing Committee, we are thrilled to invite you to the 1st Congress: "Nano Solutions Meet Big Challenges in Health"!
This international conference will unite top researchers in molecular #biology, #biomedicine, and #materials science at the #nanoscale, creating a unique platform to ignite interdisciplinary dialogue and spark collaboration.
Join us on January 23-24, 2025 at La Corrala in Madrid, Spain.
eventos.uam.es/122243/detail/1
#nanoparticles #bioimaging

Universidad Autónoma de Madrid1st Congress Nano solutions meet big challenges in healthWelcome to the 1st Congress “Nano solutions meet big challenges in health” On behalf of the Organizing Committee, we are thrilled to invite you to the 1st Congress: "Nano Solutions Meet Big Challenges in Health"! This groundbreaking international conference will unite top researchers in molecular biology, (bio)medicine, and materials science at the nanoscale, creating a unique platform to ignite interdisciplinary dialogue and spark collaboration. With a focus on innovative approaches and real-world solutions, this event promises to be a game-changer in tackling major health challenges. Join us on January 23-24, 2025 at La Corrala in Madrid, Spain—a historic "corrala" house nestled in the vibrant "El Rastro" neighborhood. This iconic venue, located at the heart of the city, serves as the perfect backdrop for showcasing the creativity and scientific innovation of the Autonomous University of Madrid. Expect dynamic keynote talks, engaging panel discussions, and plenty of opportunities to exchange cutting-edge ideas and methodologies. The conference aims to pave the way for exciting breakthroughs, translating these collaborations into impactful advances for human health. Why attend? - Network with leading experts from diverse fields - Explore fresh research and innovative approaches - Be part of shaping the future of health solutions at the nanoscale Save the dates: Take advantage of our early bird rates! Registration includes conference materials, coffee breaks, and lunch. We are counting on your participation and enthusiasm to make "Nano Solutions Meet Big Challenges in Health" an unforgettable, transformative experience. Let’s push the boundaries of science together! Looking forward to welcoming you to Madrid! On behalf of the Organizing Committee, Prof. Sara Cogliati, Prof. Eduardo Balsa Prof. Emma Martín Rodríguez Prof. Dirk Horst Ortgies Prof. Marta Quintanilla Morales Prof. Río Aguilar   This conference is funded by the Autonomous University of Madrid and the Social Council as funding entities for the Organization of Scientific Conferences of the UAM's Own Research Program.
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